Estaciones meteorológicas.
Existen cuatro estaciones meteorológicas localizadas en distintos puntos del municipio: Ensenada, Bahía de Los Ángeles, El Arco y Las Escobas.

Fundamentalmente existen dos tipos genéricos de climas: los templados húmedos que se presentan en las partes altas de las sierras y los secos que se localizan en el resto del municipio, en ambos climas se caracterizan por fuertes oscilaciones térmicas y pluviométricas.

Además se tienen registrados 6 tipos o subtipos de clima, prevaleciendo el clima muy seco semicálido, que se manifiesta en el 43.54% de la superficie del territorio municipal, siguiéndole el clima seco templado, existente en el 24.25% del territorio; en tercer lugar el clima muy seco templado que se manifiesta en el 18.94% del municipio incluyendo la zona de la ciudad de Ensenada. El resto de la superficie se distribuye en clima muy seco muy cálido, semifrío subhúmedo con lluvias en invierno, con el 7.08%, 3.54% y 2.65% de la superficie del municipio respectivamente.

Temperaturas.
Las temperaturas mínimas y máximas registradas dependen de la región y la localidad con fuertes oscilaciones, habiéndose registrado las siguientes temperaturas mínimas y máximas en promedio mensual, durante el periodo 1984-1993.

Temperatura media mensual (grados centígrados)
CLAVE ESTACIÓN ALTITUDMSNM MES Y AÑO MÁS CALUROSO MES Y AÑO MÁS FRÍO
16 Ensenada 24 23.8°c (julio-1987) 13°c (diciembre 1985)
2 Bahía de los Angeles 4 30.9°c (sept-1989) 14°c (feb-1985)
10 El Arco 300 27.9°c (agosto-1989) 11.8°c (enero-1985)
23 Las Escobas 50 23.9°c (sept-1984) 11.7°c (marzo-1991)

Precipitación pluvial.
Los recursos naturales están íntimamente ligados al crecimiento y desarrollo de cualquier pueblo. El agua es el recurso natural más importante, por ser vital para todas las formas de vida.

El municipio de Ensenada sufre de sequía extrema en casi toda la extensión y durante la mayor parte del año. La falta de lluvias abundantes y regulares resulta un factor negativo, y cuando existen, resultan eventuales y las más de las veces se pierden por falta de infraestructura adecuada para retenerlas.
La principal característica en la región norte de Baja California, y por ende del municipio de Ensenada, es que las lluvias caen en invierno y no en verano como sucede en el resto del país.

El patrón estacional en Baja California, varía considerablemente de un año a otro, registrándose periodos extremadamente lluviosos y otros severamente secos, con grandes consecuencias para las actividades socioeconómicas de nuestro municipio. Como ejemplo tenemos: los años de 1977/78 , 1982/83 y 1997/98 en que se registraron abundantes lluvias, causando inundaciones y deslaves en las principales ciudades así como la destrucción de puentes y carreteras en la zona rural. Mientras que los períodos de sequías registrados en los años 1973/76 y de 1987/90, causaron graves daños a la agricultura y ganadería, además de reducir peligrosamente los niveles freáticos de los acuíferos, propiciando la salinización de muchos pozos cercanos a la zona marítima en el sur del Municipio.